氨基葡萄糖和软骨素是治疗关节痛的补充剂中的常见成分，通常耐受性良好，但可能会导致某些人胃部不适。
当以典型剂量服用时，据报道，在临床试验中，氨基葡萄糖会引起轻度至中度嗜睡、皮肤反应和头痛。
葡萄糖胺还可能会增加青光眼患者的眼压，而且由于它通常来自贝类，因此可能会引起某些人的过敏反应。（注意：某些补品中含有基于植物的氨基葡萄糖成分）。
硫酸软骨素可能会使某些哮喘患者的症状恶化。
氨基葡萄糖和软骨素都可能具有抗凝血作用，如果您正在服用血液稀释药物，应在医生监督下使用。
另外，请注意某些形式的氨基葡萄糖和软骨素可能含有大量的钠，因此如果您的饮食是低钠饮食，您可能希望避免使用这些形式。